Wydawnictwo Naukowe Papieskiej Akademii Teologicznej w Krakowie powstało 1991. W tym czasie używane także nazwy: Oficyna Wydawnicza Wydawnictwa Naukowego Papieskiej Akademii Teologicznej oraz Oficyna Wydawnicza Papieskiej Akademii Teologicznej. Od 2009 Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II.

Z wybranych ksiąg Starego i Nowego Testamentu : praca zbiorowa. 1 / pod red. Tomasza Jelonka. - Kraków, 2009 (Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II)

ISBN BN online (Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II ; ISBN 978-83-89017)

Wydawnictwo Naukowe Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II, 27.10.12 http://upjp2.edu.pl/strona/ct5ujhpztt

Overcoming the secular / ed. by Teresa Obolevitch and Paweł Rojek. - Kraków, 2015. S. tyt.: (The Pontifical University of John Paul II in Krakow Press).

Pedagogiczne konteksty społecznego wsparcia rodziny / red. Grzegorz Godawa. - Kraków, 2015. S. tyt.: (Uniwersytet Papieski Jana Pawła II w Krakowie).

Redención de cautivos / Andrés Witko. - Cracovia, 2017. (Editorial de la Universidad Pontificia de Juan Pablo II de Cracovia)

Katalog zbiorów artystycznych Opactwa Mniszek Benedyktynek w Staniątkach. 1 / redakcja naukowa: Kazimierz Kuczman, Józef Skrabski, Andrzej Włodarek. - Kraków, 2018. Wydawnictwo: (Wydawnictwo Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II w Krakowie).

Słowo Boże w duchowości Karmelu / pod redakcją Jerzego Wiesława Gogoli. - Kraków, 2021. Wydawnictwo: (Wydawnictwo UPJPII).