Specjalizuje się w problematyce integracji UE i NATO z Zachodnimi Bałkanami, transformacji społeczno-politcznej w krajach bałkańskich i Słowenii, rozwojowi społeczeństwa obywatelskiego w krajach postkomunistycznych.

Kp. Bośniacki chaos = Bosnia's chaos / Wojciech Stanisławski, Marta Szpala. - Warszawa, 2009.

Paradoxes of stabilisation : Bosnia and Herzegovina from the perspective of Central Europe / ed. by Marta Szpala. - Warsaw, 2016. (pracownik w Departamencie Centralna Europa i Bałkany w Ośrodku Studiów Wschodnich)